在布丁岛区域，元素方碑解谜需要先调整盆景布局为左侧浮光山石（稻妻风格）、右侧悠优山石（蒙德风格）或磐固山石（璃月风格）。传送至布丁岛后，前往左侧山顶可发现5个雷元素方碑，观察附近雷灵的移动轨迹，其停顿点即为点亮顺序。雷灵轨迹会随解谜进度变化，需依次完成雷、风、岩三种方碑的解谜。完成雷元素方碑后，雷灵会提示风元素方碑的激活顺序；更改盆景右侧为磐固山石后，岩元素方碑的激活顺序需以雷灵新轨迹为准。

危危岛的元素方碑解谜需先切换至雾天天气，跟随出现的幻影生物观察元素符号顺序。遗迹内四个方碑需按火、风、冰、水的固定顺序激活，激活时需确认方碑上方是否出现星形标记以判断情形。错误的激活顺序会导致解谜失败，需全部重置后从头尝试。完成解谜后会出现折跃门，通往高空平台获取瑰丽宝箱。该解谜和危危岛过去和现形态无关，两种形态下解谜结局相同。

金苹果群岛的归乡漫漫路任务中，水元素方碑需调整中央风环至位置一，运用羽球穿过水元素魔环后经风环弹射激活；火元素方碑则需调整至位置二，羽球经火元素魔环弹射激活。若持有达达利亚或安柏，可直接用蓄力攻击超距离激活倒悬的方碑。风和冰元素方碑位于地面，运用对应元素人物即可直接激活。四元素方碑激活后会出现风场通道，需收集风精灵飞入隧道继续任务。

草元素方碑解谜需先获取草种子，携带草种子的人物通过重击或蓄力STG可激活被石块遮蔽的方碑。部分草元素方碑需按地面符号亮起顺序依次激活，每次成功激活会点亮下壹个方碑的符号。水位控制机关附近的四个草方碑全部激活后，水位下降会出现秘境入口。该解谜需注意草种子攻击也许被飞行障碍物阻挡，提议贴近目标后再进行攻击。